Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED9Q6R2W3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED9Q6R2W3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms