Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDE2Q6IQ49 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms