Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM208BQ5VWN6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms