Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PERM1Q5SV97 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PERM1Q5SV97 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms