Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LACTB2Q53H82 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LACTB2Q53H82 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms