Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms