Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00303Q3SY05 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms