Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NDUFAF6Q330K2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NDUFAF6Q330K2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms