Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RRN3P1Q2M238 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms