Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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PCK2Q16822 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PCK2Q16822 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PCK2Q16822 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PCK2Q16822 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PCK2Q16822 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PCK2Q16822 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PCK2Q16822 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PCK2Q16822 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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PCK2Q16822 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCK2Q16822 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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