Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA3Q16787 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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