Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HIST2H2BEQ16778 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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HIST2H2BEQ16778 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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HIST2H2BEQ16778 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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HIST2H2BEQ16778 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HIST2H2BEQ16778 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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