Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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