Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECM1Q16610 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECM1Q16610 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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