Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ZFHX3Q15911 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ZFHX3Q15911 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZFHX3Q15911 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZFHX3Q15911 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZFHX3Q15911 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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ZFHX3Q15911 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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