Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS72Q15906 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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