Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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NCOA1Q15788 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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NCOA1Q15788 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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NCOA1Q15788 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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NCOA1Q15788 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NCOA1Q15788 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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