Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF13Q15543 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms