Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SIX1Q15475 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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