Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PTPRRQ15256 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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PTPRRQ15256 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PTPRRQ15256 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PTPRRQ15256 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PTPRRQ15256 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PTPRRQ15256 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PTPRRQ15256 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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PTPRRQ15256 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PTPRRQ15256 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPRRQ15256 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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