Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LAPTM4AQ15012 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LAPTM4AQ15012 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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LAPTM4AQ15012 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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LAPTM4AQ15012 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAPTM4AQ15012 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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