Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms