Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RFTN1Q14699 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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