Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEMA3AQ14563 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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