Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms