Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCARF1Q14162 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SCARF1Q14162 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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