Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK13Q14004 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
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