Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDH18Q13634 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms