Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4BQ13620 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CUL4BQ13620 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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