Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CUL1Q13616 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL1Q13616 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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