Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCGQ13326 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms