Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1AQ13111 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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