Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN3Q13064 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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