Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BNIP3Q12983 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BNIP3Q12983 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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