Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FOXC1Q12948 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXC1Q12948 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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