Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KIF5AQ12840 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms