Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KCNMA1Q12791 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNMA1Q12791 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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