Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NIPAL4Q0D2K0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms