Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABPB1Q06547 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABPB1Q06547 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms