Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CENPCQ03188 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms