Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF17Q02223 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms