Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNC1Q01954 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms