Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MS4A2Q01362 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms