Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDC42EP1Q00587 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC42EP1Q00587 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms