Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2BQ00403 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2BQ00403 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms