Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VLDLRP98155 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VLDLRP98155 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms