Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRA2BP62995 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRA2BP62995 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TRA2BP62995 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRA2BP62995 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRA2BP62995 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRA2BP62995 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TRA2BP62995 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRA2BP62995 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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