Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVK-21P61565 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms