Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCE1P61221 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms