Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGGT1BP53609 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms